Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA6P23229 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms