Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD247P20963 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD247P20963 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD247P20963 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD247P20963 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD247P20963 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD247P20963 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD247P20963 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD247P20963 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD247P20963 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD247P20963 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD247P20963 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD247P20963 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD247P20963 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD247P20963 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD247P20963 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD247P20963 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD247P20963 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD247P20963 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CD247P20963 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD247P20963 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD247P20963 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD247P20963 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD247P20963 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD247P20963 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD247P20963 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD247P20963 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD247P20963 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD247P20963 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD247P20963 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD247P20963 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD247P20963 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD247P20963 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD247P20963 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD247P20963 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD247P20963 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD247P20963 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD247P20963 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD247P20963 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD247P20963 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD247P20963 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CD247P20963 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD247P20963 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD247P20963 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD247P20963 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD247P20963 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CD247P20963 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD247P20963 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CD247P20963 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD247P20963 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD247P20963 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD247P20963 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD247P20963 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD247P20963 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD247P20963 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD247P20963 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD247P20963 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD247P20963 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD247P20963 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD247P20963 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD247P20963 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD247P20963 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD247P20963 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD247P20963 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD247P20963 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD247P20963 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD247P20963 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD247P20963 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD247P20963 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD247P20963 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD247P20963 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD247P20963 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD247P20963 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CD247P20963 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD247P20963 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD247P20963 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD247P20963 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD247P20963 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD247P20963 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD247P20963 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD247P20963 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD247P20963 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD247P20963 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD247P20963 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD247P20963 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CD247P20963 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD247P20963 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD247P20963 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD247P20963 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD247P20963 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD247P20963 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD247P20963 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD247P20963 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD247P20963 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD247P20963 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD247P20963 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD247P20963 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD247P20963 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD247P20963 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CD247P20963 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms