Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCLP19338 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCLP19338 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCLP19338 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCLP19338 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NCLP19338 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCLP19338 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCLP19338 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCLP19338 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCLP19338 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCLP19338 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCLP19338 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NCLP19338 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCLP19338 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCLP19338 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCLP19338 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCLP19338 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCLP19338 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCLP19338 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCLP19338 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCLP19338 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCLP19338 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCLP19338 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCLP19338 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCLP19338 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCLP19338 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCLP19338 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCLP19338 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCLP19338 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCLP19338 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NCLP19338 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCLP19338 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCLP19338 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCLP19338 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NCLP19338 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCLP19338 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCLP19338 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCLP19338 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCLP19338 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCLP19338 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCLP19338 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCLP19338 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCLP19338 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCLP19338 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCLP19338 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCLP19338 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCLP19338 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NCLP19338 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCLP19338 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCLP19338 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCLP19338 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCLP19338 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCLP19338 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCLP19338 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCLP19338 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCLP19338 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCLP19338 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCLP19338 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NCLP19338 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCLP19338 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCLP19338 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCLP19338 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCLP19338 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCLP19338 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NCLP19338 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCLP19338 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCLP19338 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCLP19338 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCLP19338 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCLP19338 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCLP19338 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCLP19338 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCLP19338 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCLP19338 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCLP19338 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCLP19338 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCLP19338 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCLP19338 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCLP19338 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCLP19338 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCLP19338 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCLP19338 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCLP19338 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCLP19338 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCLP19338 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCLP19338 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCLP19338 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCLP19338 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCLP19338 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCLP19338 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCLP19338 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCLP19338 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCLP19338 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCLP19338 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCLP19338 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCLP19338 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCLP19338 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCLP19338 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCLP19338 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCLP19338 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms