Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms