Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms