Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms