Protein–RNA interactions for Protein: P0CL85

STAG3L3, STAG3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3L3P0CL85 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
STAG3L3P0CL85 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
STAG3L3P0CL85 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
STAG3L3P0CL85 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
STAG3L3P0CL85 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
STAG3L3P0CL85 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
STAG3L3P0CL85 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
STAG3L3P0CL85 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STAG3L3P0CL85 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
STAG3L3P0CL85 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STAG3L3P0CL85 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STAG3L3P0CL85 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STAG3L3P0CL85 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STAG3L3P0CL85 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STAG3L3P0CL85 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
STAG3L3P0CL85 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STAG3L3P0CL85 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STAG3L3P0CL85 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
STAG3L3P0CL85 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms