Protein–RNA interactions for Protein: P08195

SLC3A2, 4F2 cell-surface antigen heavy chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A2P08195 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC3A2P08195 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms