Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-DOAP06340 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms