Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL2A1P02458 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms