Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LGR5O75473 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGR5O75473 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGR5O75473 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LGR5O75473 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGR5O75473 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGR5O75473 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGR5O75473 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGR5O75473 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGR5O75473 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGR5O75473 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGR5O75473 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LGR5O75473 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGR5O75473 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGR5O75473 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGR5O75473 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGR5O75473 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGR5O75473 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGR5O75473 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGR5O75473 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGR5O75473 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LGR5O75473 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGR5O75473 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGR5O75473 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGR5O75473 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGR5O75473 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGR5O75473 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGR5O75473 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGR5O75473 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGR5O75473 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGR5O75473 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGR5O75473 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGR5O75473 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGR5O75473 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGR5O75473 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGR5O75473 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGR5O75473 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGR5O75473 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGR5O75473 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGR5O75473 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGR5O75473 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LGR5O75473 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGR5O75473 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGR5O75473 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGR5O75473 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGR5O75473 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGR5O75473 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGR5O75473 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
LGR5O75473 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LGR5O75473 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LGR5O75473 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LGR5O75473 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LGR5O75473 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LGR5O75473 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR5O75473 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR5O75473 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR5O75473 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR5O75473 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR5O75473 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR5O75473 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR5O75473 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR5O75473 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR5O75473 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR5O75473 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR5O75473 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR5O75473 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR5O75473 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR5O75473 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR5O75473 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR5O75473 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR5O75473 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR5O75473 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR5O75473 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR5O75473 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR5O75473 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR5O75473 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR5O75473 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR5O75473 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR5O75473 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR5O75473 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR5O75473 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR5O75473 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR5O75473 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR5O75473 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR5O75473 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR5O75473 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR5O75473 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR5O75473 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR5O75473 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR5O75473 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR5O75473 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR5O75473 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR5O75473 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGR5O75473 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGR5O75473 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGR5O75473 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LGR5O75473 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGR5O75473 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGR5O75473 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGR5O75473 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms