Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms