Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSCO60682 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MSCO60682 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSCO60682 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MSCO60682 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSCO60682 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSCO60682 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSCO60682 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSCO60682 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSCO60682 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MSCO60682 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MSCO60682 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSCO60682 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSCO60682 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSCO60682 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSCO60682 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSCO60682 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSCO60682 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSCO60682 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSCO60682 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSCO60682 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSCO60682 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSCO60682 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSCO60682 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSCO60682 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSCO60682 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSCO60682 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSCO60682 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSCO60682 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MSCO60682 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSCO60682 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSCO60682 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSCO60682 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSCO60682 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSCO60682 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSCO60682 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSCO60682 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSCO60682 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSCO60682 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSCO60682 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSCO60682 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MSCO60682 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSCO60682 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MSCO60682 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSCO60682 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSCO60682 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MSCO60682 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSCO60682 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSCO60682 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSCO60682 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSCO60682 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSCO60682 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSCO60682 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSCO60682 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSCO60682 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSCO60682 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSCO60682 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSCO60682 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSCO60682 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSCO60682 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MSCO60682 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSCO60682 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSCO60682 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSCO60682 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSCO60682 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MSCO60682 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSCO60682 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MSCO60682 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSCO60682 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSCO60682 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSCO60682 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSCO60682 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MSCO60682 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSCO60682 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MSCO60682 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSCO60682 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSCO60682 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSCO60682 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSCO60682 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSCO60682 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSCO60682 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSCO60682 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSCO60682 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MSCO60682 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MSCO60682 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSCO60682 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSCO60682 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSCO60682 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSCO60682 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSCO60682 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSCO60682 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSCO60682 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSCO60682 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSCO60682 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSCO60682 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSCO60682 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSCO60682 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSCO60682 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSCO60682 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSCO60682 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms