Protein–RNA interactions for Protein: O60494

CUBN, Cubilin, humanhuman

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUBNO60494 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUBNO60494 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUBNO60494 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUBNO60494 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUBNO60494 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUBNO60494 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUBNO60494 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUBNO60494 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CUBNO60494 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUBNO60494 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUBNO60494 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUBNO60494 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUBNO60494 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUBNO60494 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUBNO60494 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUBNO60494 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUBNO60494 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUBNO60494 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUBNO60494 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUBNO60494 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUBNO60494 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUBNO60494 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUBNO60494 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUBNO60494 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUBNO60494 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUBNO60494 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUBNO60494 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUBNO60494 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUBNO60494 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CUBNO60494 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUBNO60494 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUBNO60494 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CUBNO60494 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUBNO60494 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUBNO60494 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUBNO60494 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUBNO60494 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CUBNO60494 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUBNO60494 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUBNO60494 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUBNO60494 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUBNO60494 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUBNO60494 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUBNO60494 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUBNO60494 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUBNO60494 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUBNO60494 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUBNO60494 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUBNO60494 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUBNO60494 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUBNO60494 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUBNO60494 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUBNO60494 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUBNO60494 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUBNO60494 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUBNO60494 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUBNO60494 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUBNO60494 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUBNO60494 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CUBNO60494 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CUBNO60494 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CUBNO60494 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUBNO60494 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUBNO60494 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUBNO60494 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUBNO60494 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUBNO60494 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUBNO60494 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUBNO60494 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUBNO60494 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CUBNO60494 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUBNO60494 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUBNO60494 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUBNO60494 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUBNO60494 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUBNO60494 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUBNO60494 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUBNO60494 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUBNO60494 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUBNO60494 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CUBNO60494 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUBNO60494 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUBNO60494 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUBNO60494 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUBNO60494 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CUBNO60494 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUBNO60494 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUBNO60494 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUBNO60494 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUBNO60494 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUBNO60494 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUBNO60494 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUBNO60494 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CUBNO60494 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CUBNO60494 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUBNO60494 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUBNO60494 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUBNO60494 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUBNO60494 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUBNO60494 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms