Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms