Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms