Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRXO43186 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRXO43186 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRXO43186 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRXO43186 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRXO43186 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRXO43186 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRXO43186 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRXO43186 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRXO43186 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRXO43186 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRXO43186 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRXO43186 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRXO43186 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRXO43186 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRXO43186 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CRXO43186 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CRXO43186 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRXO43186 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRXO43186 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRXO43186 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRXO43186 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRXO43186 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRXO43186 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRXO43186 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRXO43186 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRXO43186 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRXO43186 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRXO43186 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRXO43186 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRXO43186 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRXO43186 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRXO43186 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRXO43186 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRXO43186 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRXO43186 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRXO43186 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CRXO43186 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRXO43186 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRXO43186 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRXO43186 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CRXO43186 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRXO43186 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRXO43186 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRXO43186 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRXO43186 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRXO43186 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRXO43186 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRXO43186 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRXO43186 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRXO43186 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRXO43186 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRXO43186 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRXO43186 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRXO43186 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRXO43186 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRXO43186 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRXO43186 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRXO43186 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRXO43186 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRXO43186 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRXO43186 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRXO43186 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRXO43186 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRXO43186 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRXO43186 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRXO43186 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRXO43186 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRXO43186 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRXO43186 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRXO43186 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRXO43186 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRXO43186 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRXO43186 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRXO43186 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRXO43186 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRXO43186 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CRXO43186 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRXO43186 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRXO43186 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRXO43186 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRXO43186 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRXO43186 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRXO43186 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRXO43186 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRXO43186 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRXO43186 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRXO43186 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRXO43186 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRXO43186 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRXO43186 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRXO43186 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRXO43186 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRXO43186 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRXO43186 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRXO43186 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRXO43186 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRXO43186 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CRXO43186 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRXO43186 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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