Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GNPATO15228 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GNPATO15228 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GNPATO15228 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GNPATO15228 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GNPATO15228 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GNPATO15228 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GNPATO15228 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GNPATO15228 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GNPATO15228 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GNPATO15228 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GNPATO15228 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GNPATO15228 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GNPATO15228 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GNPATO15228 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GNPATO15228 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GNPATO15228 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GNPATO15228 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GNPATO15228 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GNPATO15228 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GNPATO15228 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNPATO15228 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNPATO15228 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNPATO15228 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNPATO15228 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNPATO15228 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNPATO15228 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNPATO15228 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNPATO15228 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GNPATO15228 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNPATO15228 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GNPATO15228 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GNPATO15228 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNPATO15228 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNPATO15228 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNPATO15228 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNPATO15228 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNPATO15228 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNPATO15228 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNPATO15228 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNPATO15228 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNPATO15228 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GNPATO15228 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GNPATO15228 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GNPATO15228 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNPATO15228 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNPATO15228 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNPATO15228 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNPATO15228 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNPATO15228 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNPATO15228 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNPATO15228 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNPATO15228 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNPATO15228 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNPATO15228 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNPATO15228 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GNPATO15228 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GNPATO15228 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GNPATO15228 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GNPATO15228 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GNPATO15228 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GNPATO15228 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GNPATO15228 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GNPATO15228 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GNPATO15228 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GNPATO15228 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GNPATO15228 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GNPATO15228 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GNPATO15228 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GNPATO15228 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GNPATO15228 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GNPATO15228 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GNPATO15228 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GNPATO15228 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GNPATO15228 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GNPATO15228 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GNPATO15228 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GNPATO15228 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GNPATO15228 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GNPATO15228 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GNPATO15228 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GNPATO15228 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GNPATO15228 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GNPATO15228 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GNPATO15228 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GNPATO15228 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GNPATO15228 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GNPATO15228 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GNPATO15228 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GNPATO15228 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GNPATO15228 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GNPATO15228 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GNPATO15228 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GNPATO15228 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GNPATO15228 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GNPATO15228 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GNPATO15228 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GNPATO15228 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GNPATO15228 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GNPATO15228 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms