Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNMO15061 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNMO15061 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNMO15061 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNMO15061 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNMO15061 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNMO15061 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNMO15061 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNMO15061 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNMO15061 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNMO15061 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNMO15061 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNMO15061 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNMO15061 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNMO15061 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNMO15061 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNMO15061 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNMO15061 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNMO15061 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNMO15061 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNMO15061 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNMO15061 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNMO15061 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNMO15061 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNMO15061 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNMO15061 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNMO15061 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNMO15061 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNMO15061 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNMO15061 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYNMO15061 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYNMO15061 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYNMO15061 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYNMO15061 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYNMO15061 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYNMO15061 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYNMO15061 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYNMO15061 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYNMO15061 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYNMO15061 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYNMO15061 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYNMO15061 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYNMO15061 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYNMO15061 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYNMO15061 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYNMO15061 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYNMO15061 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYNMO15061 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYNMO15061 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYNMO15061 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYNMO15061 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SYNMO15061 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYNMO15061 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYNMO15061 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SYNMO15061 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYNMO15061 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYNMO15061 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYNMO15061 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYNMO15061 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYNMO15061 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYNMO15061 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYNMO15061 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYNMO15061 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYNMO15061 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SYNMO15061 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYNMO15061 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYNMO15061 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYNMO15061 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SYNMO15061 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYNMO15061 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYNMO15061 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYNMO15061 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYNMO15061 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYNMO15061 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SYNMO15061 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYNMO15061 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNMO15061 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNMO15061 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNMO15061 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNMO15061 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNMO15061 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNMO15061 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNMO15061 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNMO15061 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNMO15061 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNMO15061 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNMO15061 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNMO15061 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNMO15061 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNMO15061 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNMO15061 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNMO15061 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNMO15061 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNMO15061 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNMO15061 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNMO15061 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNMO15061 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNMO15061 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNMO15061 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNMO15061 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms