Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KPNA3O00505 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KPNA3O00505 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KPNA3O00505 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KPNA3O00505 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KPNA3O00505 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KPNA3O00505 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KPNA3O00505 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KPNA3O00505 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KPNA3O00505 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KPNA3O00505 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KPNA3O00505 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KPNA3O00505 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KPNA3O00505 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KPNA3O00505 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KPNA3O00505 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KPNA3O00505 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms