Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
J3KT08 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
J3KT08 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
J3KT08 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
J3KT08 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
J3KT08 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
J3KT08 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
J3KT08 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
J3KT08 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
J3KT08 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
J3KT08 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
J3KT08 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
J3KT08 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
J3KT08 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
J3KT08 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
J3KT08 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
J3KT08 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
J3KT08 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
J3KT08 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
J3KT08 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
J3KT08 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
J3KT08 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
J3KT08 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
J3KT08 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
J3KT08 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
J3KT08 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
J3KT08 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
J3KT08 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
J3KT08 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
J3KT08 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
J3KT08 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
J3KT08 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
J3KT08 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
J3KT08 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
J3KT08 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
J3KT08 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
J3KT08 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
J3KT08 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
J3KT08 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
J3KT08 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
J3KT08 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
J3KT08 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
J3KT08 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
J3KT08 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
J3KT08 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
J3KT08 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
J3KT08 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
J3KT08 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
J3KT08 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
J3KT08 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
J3KT08 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
J3KT08 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
J3KT08 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
J3KT08 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
J3KT08 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
J3KT08 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
J3KT08 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
J3KT08 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
J3KT08 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
J3KT08 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
J3KT08 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
J3KT08 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
J3KT08 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
J3KT08 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
J3KT08 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
J3KT08 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
J3KT08 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
J3KT08 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
J3KT08 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
J3KT08 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
J3KT08 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
J3KT08 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
J3KT08 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
J3KT08 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
J3KT08 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
J3KT08 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
J3KT08 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
J3KT08 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
J3KT08 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
J3KT08 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
J3KT08 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
J3KT08 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
J3KT08 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
J3KT08 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
J3KT08 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
J3KT08 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
J3KT08 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
J3KT08 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
J3KT08 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
J3KT08 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms