Protein–RNA interactions for Protein: H7C1C5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1C5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H7C1C5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H7C1C5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H7C1C5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H7C1C5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H7C1C5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H7C1C5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H7C1C5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H7C1C5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H7C1C5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H7C1C5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H7C1C5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H7C1C5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H7C1C5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H7C1C5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H7C1C5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H7C1C5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
H7C1C5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
H7C1C5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
H7C1C5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H7C1C5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H7C1C5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H7C1C5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H7C1C5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H7C1C5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
H7C1C5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H7C1C5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H7C1C5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H7C1C5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H7C1C5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H7C1C5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
H7C1C5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
H7C1C5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H7C1C5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H7C1C5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H7C1C5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H7C1C5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H7C1C5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H7C1C5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H7C1C5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H7C1C5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H7C1C5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H7C1C5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H7C1C5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H7C1C5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H7C1C5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H7C1C5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H7C1C5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H7C1C5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H7C1C5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H7C1C5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H7C1C5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H7C1C5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H7C1C5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H7C1C5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H7C1C5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H7C1C5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H7C1C5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H7C1C5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H7C1C5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H7C1C5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H7C1C5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H7C1C5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H7C1C5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H7C1C5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H7C1C5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H7C1C5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H7C1C5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H7C1C5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H7C1C5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H7C1C5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H7C1C5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H7C1C5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H7C1C5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H7C1C5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H7C1C5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H7C1C5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H7C1C5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H7C1C5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H7C1C5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H7C1C5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H7C1C5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
H7C1C5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
H7C1C5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H7C1C5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H7C1C5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H7C1C5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H7C1C5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H7C1C5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H7C1C5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H7C1C5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H7C1C5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H7C1C5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H7C1C5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H7C1C5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H7C1C5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
H7C1C5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H7C1C5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H7C1C5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H7C1C5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms