Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms