Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ERVV-1B6SEH8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms