Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ZNF316A6NFI3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms