Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms