Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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COL4A6Q14031 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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COL4A6Q14031 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
COL4A6Q14031 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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