Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 KYNU-203ENST00000409512 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AL590542.1-201ENST00000449314 1596 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 SPATA31A7-206ENST00000619167 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 RAPGEF5-201ENST00000344041 6621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AL591379.1-201ENST00000315293 3739 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 FAR2P1-201ENST00000325390 3679 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 NARS2-204ENST00000528850 2137 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 MDGA2-203ENST00000426342 2871 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC097634.1-201ENST00000604491 2467 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 FBXW10-201ENST00000301938 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 LDHA-206ENST00000430553 1310 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 LRTOMT-210ENST00000447974 2007 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 CLRN1-202ENST00000327047 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC135068.1-201ENST00000332663 1084 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 SPATA20P1-201ENST00000423089 438 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC007365.2-201ENST00000428806 458 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 E2F6P3-201ENST00000441743 743 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 PSPC1P2-201ENST00000455130 225 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 RPL10P18-201ENST00000519384 309 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 PTTG3P-201ENST00000521862 606 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC006205.1-201ENST00000538067 389 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 OR4C49P-201ENST00000563891 900 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC011824.1-201ENST00000584863 561 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC005837.2-201ENST00000587459 479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC011462.3-201ENST00000598988 540 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 LINC00184-201ENST00000429269 2270 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 ACOD1-201ENST00000377462 2165 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 GTF2H3-212ENST00000543341 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 ADAM2-201ENST00000265708 2672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 COQ10B-202ENST00000409010 1355 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC093227.1-201ENST00000588040 1360 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC009812.3-201ENST00000523871 3766 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 MRPS17P1-201ENST00000596009 3130 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 LINC01359-204ENST00000447748 2804 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 TRIM42-201ENST00000286349 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC005614.1-201ENST00000598952 3653 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 SMG1P4-203ENST00000517529 1589 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 CD209-205ENST00000394161 507 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AL359715.1-201ENST00000404330 555 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AF274855.1-201ENST00000411474 850 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC009743.1-201ENST00000415774 610 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 RPL34P19-201ENST00000415903 342 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AL133268.2-201ENST00000416595 430 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 GEMIN2P2-201ENST00000418195 715 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC009500.1-201ENST00000420684 583 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 LINC01384-201ENST00000422494 659 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC104698.1-201ENST00000435671 276 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 PIP5K1P2-201ENST00000437005 1120 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AL096803.1-201ENST00000456921 1021 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC016822.1-201ENST00000457975 439 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 RPL23P10-201ENST00000468780 412 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC139713.2-212ENST00000506982 832 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 B3GNTL1P1-201ENST00000509174 289 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 KCNU1-202ENST00000518904 334 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC011603.2-202ENST00000552893 504 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms