Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 GPR33-201ENST00000399285 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 RNA5SP396-201ENST00000364834 120 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 S100A7-201ENST00000368722 442 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 C1orf162-202ENST00000369718 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 ARMCX7P-201ENST00000372828 562 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 MIR614-201ENST00000385082 90 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 MIR152-201ENST00000385212 87 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 RPL36A-202ENST00000392994 691 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 PPIAP30-201ENST00000415473 519 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AL451164.1-201ENST00000417149 390 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AC110995.1-202ENST00000422914 860 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 HBBP1-201ENST00000433329 439 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 RPL21P33-201ENST00000444831 484 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AL392046.1-201ENST00000450742 569 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 RPL23AP68-201ENST00000480924 445 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 TMEM150C-203ENST00000508701 566 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AC099687.1-201ENST00000531798 510 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 COX6CP11-201ENST00000555293 229 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 RN7SL664P-201ENST00000584239 305 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AC011498.1-203ENST00000589066 359 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AL669830.1-201ENST00000621457 656 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 SMIM11B-203ENST00000622934 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 MFSD8-256ENST00000641949 1640 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AL353753.1-201ENST00000612217 2320 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 TMEM230-204ENST00000379277 1536 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 DCX-206ENST00000496551 1320 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 CNTNAP2-203ENST00000463592 6076 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 CDY19P-201ENST00000411668 1613 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 CDY18P-201ENST00000438294 1609 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AC068138.1-201ENST00000412635 217 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 IFNA12P-201ENST00000413147 571 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AC009237.9-201ENST00000414800 347 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 RTCA-AS1-201ENST00000421185 423 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AC092066.1-201ENST00000425131 317 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AL162724.2-201ENST00000426157 308 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 NQO1-204ENST00000439109 924 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AC091730.1-201ENST00000440455 692 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 LINC00460-203ENST00000444865 739 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AC009970.1-201ENST00000444873 432 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 GHRL-210ENST00000449238 440 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 RN7SL685P-201ENST00000476271 298 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 SEC62-AS1-201ENST00000479626 346 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AC007106.1-201ENST00000509666 600 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AC018541.1-201ENST00000517706 764 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AL135934.1-201ENST00000527684 537 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AC067735.1-201ENST00000551152 526 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AC084033.2-201ENST00000551532 967 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AC130456.5-201ENST00000569345 510 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 LINC01919-201ENST00000578610 568 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 CARSP1-201ENST00000603171 889 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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