Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 AL358394.2-201ENST00000427229 3637 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 AP002001.1-202ENST00000525797 1754 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 ZNF699-201ENST00000308650 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 CASC15-201ENST00000444265 1497 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 CD200R1L-201ENST00000398214 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 ERMN-202ENST00000409216 746 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 AL713923.1-201ENST00000414071 378 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 AC010148.1-201ENST00000427619 707 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 DIRC3-AS1-201ENST00000452813 557 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 AC105150.1-201ENST00000518011 551 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 TPT1-AS1-209ENST00000520585 818 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 AC019080.4-201ENST00000606200 564 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 U91328.4-201ENST00000608919 517 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 AC026951.2-201ENST00000613847 241 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 SSXP3-201ENST00000442971 1300 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 YES1-201ENST00000314574 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 CDY2A-202ENST00000426790 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 CDY2B-202ENST00000544303 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 FPGT-TNNI3K-201ENST00000370893 1195 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 AF274855.1-201ENST00000411474 850 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 MORF4L1P5-201ENST00000433352 961 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 AC106874.1-201ENST00000440495 646 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 AL117382.2-201ENST00000455642 403 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 BBOF1-202ENST00000463558 550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 UCK2-206ENST00000470820 1083 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 RPL23AP80-201ENST00000495605 424 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 AC025419.1-203ENST00000540652 726 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 AC073539.3-201ENST00000601905 386 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 ZNF540-202ENST00000343599 3073 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 AC020978.6-201ENST00000571197 3177 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IMP3Q9NV31 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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