Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC015914.1-201ENST00000558050 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC087292.1-201ENST00000573371 512 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC068418.1-201ENST00000582990 404 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC011447.2-201ENST00000592921 283 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 GOSR2-222ENST00000639031 885 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC102941.1-201ENST00000567616 1537 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 IAPP-205ENST00000542023 2015 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 RPS6KA6-201ENST00000262752 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 ELOC-205ENST00000520210 1451 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 IMPG1-201ENST00000369950 3558 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 PAPPA-AS2-201ENST00000438048 1854 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 ZNF880-202ENST00000422689 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC007278.1-201ENST00000450893 1327 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 SPAG11B-201ENST00000297498 795 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 HYPM-201ENST00000341016 501 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 S100A4-201ENST00000354332 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 RNA5SP114-201ENST00000363780 113 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 FABP3-201ENST00000373713 725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 MIR1231-201ENST00000408101 92 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 LINC01505-201ENST00000411451 686 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 ELMO1-AS1-201ENST00000419535 528 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC018804.1-201ENST00000430381 618 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 MYO5BP3-201ENST00000431872 1279 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 HSFX3-201ENST00000431993 1264 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 ATP5LP4-201ENST00000434169 307 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 OSTCP2-201ENST00000437956 444 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC009518.3-201ENST00000438972 253 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC092801.1-201ENST00000443763 581 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC083864.2-201ENST00000446024 482 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AL354714.5-201ENST00000450131 590 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 LINC01839-201ENST00000451348 727 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 PCMTD1P3-201ENST00000451824 472 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 GAPDHP53-201ENST00000458397 924 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 RN7SL379P-201ENST00000479912 293 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC105202.1-203ENST00000518024 875 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC022973.2-201ENST00000520146 549 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC156455.1-201ENST00000538790 851 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 TGFB3-AS1-201ENST00000553732 580 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC022469.1-201ENST00000555291 656 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC025430.1-201ENST00000561324 498 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC010519.1-201ENST00000599924 344 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC092960.1-201ENST00000604762 351 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 LINC01396-201ENST00000609099 527 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AMPD3-209ENST00000529507 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 SLC2A3P2-201ENST00000331747 1480 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 LIMA1-202ENST00000394943 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 LRRC37A12P-201ENST00000454917 1801 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 MIR205HG-201ENST00000366437 704 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 CNTRL-202ENST00000373844 713 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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