Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 C16orf62-224ENST00000567245 573 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 RPS7P1-201ENST00000571702 585 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC008551.1-201ENST00000575612 405 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 EIF4A3P1-201ENST00000578499 647 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 LINC01255-203ENST00000587189 591 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AL121985.1-203ENST00000588034 556 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 TREM1-204ENST00000589614 772 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AL356052.1-201ENST00000605764 376 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 LAMTOR5-AS1-248ENST00000630488 703 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 CR589904.1-203ENST00000636515 318 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC017000.1-201ENST00000639380 578 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 OR7E161P-202ENST00000641994 1033 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC105383.1-202ENST00000505289 2820 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 ZMYND11-204ENST00000381604 4066 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 CREM-218ENST00000460270 1416 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 R3HCC1L-206ENST00000613938 1397 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 CLEC1B-202ENST00000348658 869 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 RNA5SP396-201ENST00000364834 120 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 NALCN-202ENST00000376200 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 MIR152-201ENST00000385212 87 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 LYSMD1-202ENST00000440902 1003 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 GTF2F2P2-201ENST00000445825 721 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC016683.1-201ENST00000446590 559 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC096915.1-201ENST00000456185 512 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC117382.1-201ENST00000468074 730 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 RN7SL58P-201ENST00000473445 294 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 LINC02218-201ENST00000503267 529 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC122710.2-201ENST00000506093 596 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC011595.1-201ENST00000548901 753 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC012157.1-201ENST00000549725 501 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AL157871.5-201ENST00000555212 533 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC103740.1-204ENST00000557994 570 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 PCBP1-AS1-244ENST00000594376 1197 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC007785.3-202ENST00000601033 518 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC073539.3-201ENST00000601905 386 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC027271.1-201ENST00000610270 610 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 Metazoa_SRP.39-201ENST00000614194 271 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 RN7SL126P-201ENST00000616400 299 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC016542.3-201ENST00000623520 619 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 NPLOC4-221ENST00000625705 405 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms