Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC067942.1-201ENST00000488045 1493 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 MKI67P1-201ENST00000604297 1460 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 CACNA1D-211ENST00000636570 6441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 NR1I3-202ENST00000367980 1403 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 RBMY1A3P-201ENST00000382670 1404 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 DPPA4-201ENST00000335658 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 EEF1A1P20-201ENST00000514852 1386 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 FARSB-201ENST00000281828 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 HESX1-201ENST00000295934 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 RN7SKP38-201ENST00000410782 309 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 NUCB1-AS1-201ENST00000416432 433 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 WWC3-AS1-201ENST00000430057 578 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AL645568.1-202ENST00000437190 1016 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AL138930.1-201ENST00000446952 635 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AGK-205ENST00000492693 1046 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 ZNF721-203ENST00000506646 935 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC004063.1-201ENST00000508358 547 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 RN7SKP233-201ENST00000517005 110 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 PSMA3-AS1-206ENST00000555037 446 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 UBE2CP1-201ENST00000557130 554 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC007614.3-201ENST00000564875 654 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC007861.1-201ENST00000576671 674 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AL121830.1-206ENST00000608476 1254 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 EAPP-205ENST00000618169 1237 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 LINC01440-208ENST00000627300 699 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 LINC00251-201ENST00000627569 1055 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 BCLAF1-223ENST00000628517 2512 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AL034397.3-202ENST00000621933 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 ARHGAP42P4-201ENST00000549782 2934 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 POGZ-218ENST00000531094 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 SEC23IP-208ENST00000543134 1461 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 CDC40-201ENST00000307731 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
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HOXD12P35452 LRRC37A12P-201ENST00000454917 1801 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AL049647.1-201ENST00000319682 1789 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 CCL1-201ENST00000225842 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 IL22-201ENST00000328087 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 IGBP1-AS2-201ENST00000403371 513 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AL590143.1-201ENST00000405071 138 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 SPATA20P1-201ENST00000423089 438 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC007365.1-201ENST00000439964 627 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AL354714.5-201ENST00000450131 590 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC093627.1-201ENST00000465755 877 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 DPH5-211ENST00000488176 1034 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 OXR1-212ENST00000521592 993 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC013546.1-201ENST00000523232 564 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AP003555.2-201ENST00000528507 655 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
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