Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 AC006116.6-201ENST00000593258 1103 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF525-206ENST00000593918 590 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AL023806.2-201ENST00000603042 263 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 MIR7162-201ENST00000611134 69 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC018558.4-201ENST00000622153 281 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 OR8D2-201ENST00000624618 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01002-204ENST00000631644 473 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 SGO1-AS1-206ENST00000635369 442 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 CASC19-212ENST00000641153 1287 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 CASP10-203ENST00000313728 1521 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 PDZK1P1-201ENST00000401008 3498 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 GPCPD1-201ENST00000379019 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC097478.1-207ENST00000612706 2422 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC77-210ENST00000540180 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 MACROD2-203ENST00000402914 4425 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 SLC14A1-221ENST00000619403 3823 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 WDR89-202ENST00000394942 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 ADAMTS9-AS2-202ENST00000474768 2388 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 PSG9-206ENST00000593948 1429 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC007731.1-202ENST00000610338 1870 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC091806.1-201ENST00000452690 3000 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 ERLIN2-211ENST00000523887 2347 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 TPPP2-201ENST00000321760 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 RPL24P7-201ENST00000399435 453 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 LL22NC01-81G9.3-201ENST00000400221 992 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AL390195.1-202ENST00000416099 723 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AL133268.2-201ENST00000416595 430 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AL158070.1-201ENST00000421614 631 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 OR7E117P-201ENST00000422682 1112 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 VDAC2P3-201ENST00000430995 828 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 PMS2P11-201ENST00000451831 574 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFB4P1-201ENST00000462398 381 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 XAGE1B-205ENST00000518075 472 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 RPL10P18-201ENST00000519384 309 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 IGLVI-42-201ENST00000522485 381 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC011595.1-201ENST00000548901 753 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC016747.2-203ENST00000606876 289 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 ELMO2P1-201ENST00000611569 473 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC108861.1-201ENST00000611634 585 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 uc_338.37-201ENST00000620113 186 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 PDAP1-205ENST00000626285 120 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01173-201ENST00000629370 331 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AL590396.3-201ENST00000636334 300 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 TLR10-204ENST00000506111 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 NUP210L-202ENST00000368553 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01360-203ENST00000440762 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM269-204ENST00000637012 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 TUBBP10-201ENST00000427668 1301 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 UBN1-208ENST00000590769 3530 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 ECI2-204ENST00000380125 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 CDC40-201ENST00000307731 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 MMACHC-203ENST00000616135 1510 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 ACOD1-201ENST00000377462 2165 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 SMG1-210ENST00000565224 2372 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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