Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 NUSAP1-202ENST00000414849 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 AL590065.1-201ENST00000603371 4774 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 SLC11A2-201ENST00000262051 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 ACKR2-201ENST00000422265 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 SAMMSON-222ENST00000641901 2727 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 MED6-212ENST00000615788 1700 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 ZMYM6-203ENST00000373333 1473 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 ACSL4-204ENST00000469796 5225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 LINC02477-201ENST00000512652 1417 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 AC096582.3-201ENST00000636578 3716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 HRH1-203ENST00000431010 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 EPHA6-204ENST00000502694 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 ZNF845-202ENST00000595091 4413 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 OR1C1-201ENST00000408896 1307 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 THSD4-AS1-202ENST00000562634 2182 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 VNN3-202ENST00000367927 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 DEFA6-201ENST00000297436 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 CFAP61-203ENST00000377293 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 AL583856.1-201ENST00000454078 1101 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 AC131233.1-201ENST00000479200 955 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 RN7SL705P-201ENST00000481678 294 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 AC113404.1-201ENST00000502589 756 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 AC087273.2-201ENST00000519038 634 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 AL136018.1-202ENST00000555300 488 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 NUDT7-206ENST00000568787 678 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 AP005329.3-201ENST00000609924 686 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 OR8D2-201ENST00000624618 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 HIPK1-201ENST00000340480 6997 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 AC087280.2-201ENST00000637205 4822 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 INTS7-204ENST00000440600 3136 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 AC092646.2-201ENST00000431242 2095 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 SAMD3-204ENST00000439090 2093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 BEST3-205ENST00000488961 2878 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 DNAJC5G-203ENST00000404433 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 MLIP-201ENST00000274897 1815 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 TMEM155-203ENST00000394396 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM71Q2Q1W2 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 WDR44-201ENST00000254029 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AMOT-204ENST00000371962 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 RBM11-201ENST00000400577 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 ZC3H8-202ENST00000409573 5965 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 PGM3-212ENST00000513973 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 KPNA1-201ENST00000344337 6830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 ELMO1-AS1-201ENST00000419535 528 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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