Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 AC005808.1-201ENST00000444112 381 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 AF196972.1-201ENST00000445586 653 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 PMS2P11-201ENST00000451831 574 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 PSPC1P2-201ENST00000455130 225 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 CXCR6-203ENST00000457814 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 CYB5A-204ENST00000494131 776 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 AC008967.1-201ENST00000504843 163 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 AC096741.2-201ENST00000510225 637 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 C14orf159-213ENST00000519019 834 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 LINC01288-201ENST00000519189 529 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 ST13P6-201ENST00000522430 1102 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 AP003555.2-201ENST00000528507 655 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 AC068831.6-201ENST00000560522 795 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 LINC02180-201ENST00000566439 1010 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 MAGEB5-201ENST00000602297 1216 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 AC016747.2-203ENST00000606876 289 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 AC106795.5-201ENST00000623288 454 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 AL590396.3-201ENST00000636334 300 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 FGL2-202ENST00000637771 989 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 CREM-216ENST00000429130 1476 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 FOLH1B-202ENST00000529567 2145 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 SOCS5P5-201ENST00000402732 1586 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 EPHA6-204ENST00000502694 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 AL355306.2-202ENST00000634380 2281 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 LINC00310-204ENST00000430922 2086 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 EZH1-222ENST00000592743 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 MRPS31-201ENST00000323563 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 AC113608.1-201ENST00000398740 305 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 AC009413.1-201ENST00000414823 399 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 AL121916.1-201ENST00000429405 308 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 OSTN-AS1-201ENST00000430375 515 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 CDK7P1-201ENST00000434574 693 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 AC022730.1-201ENST00000473114 568 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 AC131233.1-201ENST00000479200 955 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 AF305872.1-201ENST00000485217 471 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 AL079303.1-201ENST00000486611 463 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 AC007106.1-201ENST00000509666 600 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 LACTB2-AS1-204ENST00000519167 793 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 RGS5-220ENST00000528689 566 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 LINC00640-201ENST00000554409 498 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 LINC01919-203ENST00000581198 598 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 AC011447.3-202ENST00000593655 555 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 OR5AH1P-201ENST00000595968 283 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 ZNF415-218ENST00000599261 601 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 uc_338.21-201ENST00000622458 147 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 AC117503.3-201ENST00000623811 601 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 GRXCR2-201ENST00000377976 2002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 AC244100.3-202ENST00000617328 1721 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 SPRY1-201ENST00000339241 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ACTN2P35609 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms