Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 MKX-AS1-201ENST00000412244 745 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 SNX18P13-201ENST00000412442 529 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AC016716.2-201ENST00000418621 486 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 LINC01497-201ENST00000420427 665 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 FNDC3B-205ENST00000423424 408 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 LINC00266-1-202ENST00000425473 629 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 GAPDHP69-201ENST00000425504 1008 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 LINC01747-201ENST00000437696 1067 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 PMS2P9-201ENST00000441237 515 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 MAGEC3-203ENST00000443323 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AL391863.1-202ENST00000457427 612 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 RPSAP48-201ENST00000466509 889 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AC034206.1-201ENST00000509372 474 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 C14orf159-213ENST00000519019 834 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AP001803.1-201ENST00000525668 147 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 RRM1-AS1-201ENST00000529323 346 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AL132640.2-202ENST00000559732 614 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AC110603.1-201ENST00000580645 468 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AF186192.2-204ENST00000581667 524 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 ZNF397-211ENST00000592264 1104 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AC087894.3-201ENST00000623682 349 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 LINC00251-201ENST00000627569 1055 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 OR5P3-202ENST00000641167 1193 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 ASNS-214ENST00000455086 1588 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 MEPE-201ENST00000361056 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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RTL8BQ17RB0 AL049869.1-201ENST00000556933 1402 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC100810.3-201ENST00000633189 2240 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 ZNF438-203ENST00000375311 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 PSMD10-204ENST00000361815 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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RTL8BQ17RB0 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AL355472.1-201ENST00000451795 575 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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RTL8BQ17RB0 AP003119.2-201ENST00000528075 336 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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RTL8BQ17RB0 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 RAB2B-201ENST00000397762 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 DAZ1-203ENST00000426000 1846 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AL451064.2-201ENST00000623514 1654 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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