Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 LINC01919-203ENST00000581198 598 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 NAPEPLD-209ENST00000465647 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 ERC1-204ENST00000397203 9118 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 LINC01095-202ENST00000507726 1715 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 NPIPB6-201ENST00000532254 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 WDR64-204ENST00000437684 2310 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 ZNF658-206ENST00000621410 4025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 NNT-201ENST00000264663 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 SIRPB1-205ENST00000381605 3241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 CD160-205ENST00000616463 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 CD300E-201ENST00000392619 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 SLC14A2-203ENST00000586448 3540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 SCN9A-201ENST00000303354 9786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 DHX57-203ENST00000457308 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 ADGRL3-209ENST00000508693 5009 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 TSHZ2-203ENST00000603338 3803 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 NRXN3-203ENST00000428277 4219 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 RNF146-210ENST00000608991 2169 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 AC090983.1-201ENST00000623426 3897 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 RPL5P8-201ENST00000396820 815 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 ANKRD54P1-201ENST00000433115 471 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 PDE4DIP-208ENST00000464103 1055 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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HTR4Q13639 AC006487.2-201ENST00000503624 577 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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HTR4Q13639 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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HTR4Q13639 SCML1-203ENST00000380045 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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HTR4Q13639 ZNF844-202ENST00000441304 2036 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 CUZD1-206ENST00000392790 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 LRAT-206ENST00000507827 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 HYDIN-206ENST00000393567 15719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 NOX1-204ENST00000372966 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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HTR4Q13639 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 TMC5-205ENST00000542583 4872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 AADACL3-201ENST00000359318 3662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 ADGRA3-209ENST00000508133 1572 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 APP-206ENST00000359726 3294 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HTR4Q13639 LINC02324-201ENST00000531609 1442 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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