Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 TRAV12-3-201ENST00000390442 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 CHL1-AS1-201ENST00000417612 913 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 RAC1P4-201ENST00000419413 579 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AL593856.1-201ENST00000419949 805 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AL354893.1-201ENST00000433735 348 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC106874.1-201ENST00000440495 646 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 RN7SKP198-201ENST00000459286 306 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 OXR1-212ENST00000521592 993 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC116903.1-201ENST00000557683 539 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 DLGAP1-AS3-201ENST00000577649 1258 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC015818.3-202ENST00000579603 283 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC098590.2-201ENST00000614787 281 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC130448.2-201ENST00000624082 374 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 SATB1-AS1-242ENST00000627496 807 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 LINC00251-201ENST00000627569 1055 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 ADA2-201ENST00000262607 3925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 SP110-203ENST00000358662 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 PIGN-233ENST00000639342 4305 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 MKI67P1-201ENST00000604297 1460 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 DCX-205ENST00000488120 2476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 CXCR2P1-201ENST00000439871 2503 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 C18orf54-206ENST00000620105 5693 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 TP53BP1-202ENST00000382039 6015 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 TRIM51HP-202ENST00000530412 1823 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 PDLIM5-219ENST00000514743 3356 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 BX322650.1-201ENST00000332359 2143 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 LRRC31-201ENST00000264676 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 DUXAP8-203ENST00000437781 2398 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 KLHL8-203ENST00000498875 5175 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 SLC4A4-204ENST00000425175 7596 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 OR4K1-201ENST00000285600 1076 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 OR10D3-201ENST00000318666 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 RNA5SP472-201ENST00000363868 119 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 TRBV28-201ENST00000390400 364 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 RPL5P6-201ENST00000425640 886 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AL596268.1-201ENST00000427910 1048 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 RHEBP1-201ENST00000448647 556 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 RN7SL751P-201ENST00000473281 284 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 PFN2-213ENST00000494827 793 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC008967.1-201ENST00000504843 163 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 RN7SKP11-201ENST00000517018 287 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AL023284.3-202ENST00000571188 543 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 WBP1LP11-201ENST00000586141 328 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 MIR8089-201ENST00000620165 82 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC099667.1-201ENST00000624222 469 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC073263.3-201ENST00000624449 858 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AL132796.3-201ENST00000624703 900 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC119674.1-201ENST00000641611 1210 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 FAM122C-201ENST00000370784 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.8 ms