Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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USP18Q9UMW8 IFT74-202ENST00000429045 1462 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 SEC23IP-208ENST00000543134 1461 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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USP18Q9UMW8 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 AL359396.1-201ENST00000623151 2376 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 ASAH1-267ENST00000637991 2399 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 RRM2-213ENST00000641198 3431 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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USP18Q9UMW8 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 AP1M1-201ENST00000291439 13193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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