Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 LINC01646-202ENST00000634256 1107 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 FGD4-202ENST00000427716 8242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 TMCC1-203ENST00000432054 5631 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 AC087392.3-202ENST00000358446 1754 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 AC022613.3-201ENST00000560740 1346 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 CNR1-202ENST00000369499 5549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 TRAV5-201ENST00000390427 352 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 RPL41P2-201ENST00000544920 409 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 EXOC5-211ENST00000621441 10589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 NIPBL-201ENST00000282516 10435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 FRY-207ENST00000542859 13200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 PKD1L1-201ENST00000289672 9092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 PLEKHA5-201ENST00000299275 4238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 AC125603.4-201ENST00000621942 2699 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 ETS1-202ENST00000392668 5139 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 EPS8-213ENST00000543612 2965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 RN7SKP38-201ENST00000410782 309 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 AC024451.1-201ENST00000508013 779 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 FBXO16-208ENST00000519471 398 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 PVT1-214ENST00000522875 922 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 ZNF438-208ENST00000538351 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 SLC4A4-204ENST00000425175 7596 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 NLGN4X-201ENST00000275857 5454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 AL031595.3-201ENST00000624919 14262 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 AC131649.2-201ENST00000624925 4439 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 CLASP1-203ENST00000409078 8002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 GRIK1-AS1-202ENST00000412579 818 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 RPSAP68-201ENST00000625020 438 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 FAM71F1-207ENST00000485070 1574 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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