Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 RN7SL702P-201ENST00000488394 292 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC006070.1-201ENST00000508151 193 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 SCARNA6-201ENST00000515982 265 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 KCNU1-202ENST00000518904 334 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC068790.1-201ENST00000536166 355 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC084880.4-201ENST00000538405 577 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC087257.2-201ENST00000538759 928 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC053513.1-201ENST00000543604 738 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 PFDN5-214ENST00000551018 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC011447.3-205ENST00000592022 1268 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 CCL4L2-216ENST00000620098 836 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 ENSA-215ENST00000638926 360 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC093227.1-201ENST00000588040 1360 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 IL37-203ENST00000349806 589 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 RNU1-38P-201ENST00000362817 144 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 C1orf162-202ENST00000369718 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 OR5P4P-201ENST00000424698 917 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AC068137.1-201ENST00000429272 584 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 RN7SL516P-201ENST00000496127 297 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AC007106.1-201ENST00000509666 600 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AC114801.1-201ENST00000512633 297 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AC005699.1-203ENST00000515286 688 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 LINC01944-201ENST00000517916 416 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 LACTB2-AS1-204ENST00000519167 793 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AP003548.1-201ENST00000523862 711 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AP001007.2-201ENST00000525429 593 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AC087277.1-201ENST00000529910 535 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 LINC00663-205ENST00000589508 432 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 IZUMO3-203ENST00000604921 743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AC027271.1-201ENST00000610270 610 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AC025287.2-201ENST00000621911 668 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 RALYL-204ENST00000518566 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 LDHA-206ENST00000430553 1310 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 TMED2-203ENST00000509052 1975 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 MFSD8-256ENST00000641949 1640 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 GCSAML-204ENST00000463359 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 SCFD1-202ENST00000396629 2021 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 OR2AT4-201ENST00000305159 1042 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 TMED5-201ENST00000370280 750 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 PPP1R17-202ENST00000409146 569 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AP001043.1-203ENST00000415824 407 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AL158070.1-201ENST00000421614 631 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 RPSAP49-201ENST00000445182 886 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 RN7SL688P-201ENST00000471754 275 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 SERPINB5-205ENST00000489441 1268 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 RN7SL306P-201ENST00000492941 296 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AC021491.1-201ENST00000502300 349 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
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