Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AC090643.1-201ENST00000623600 3100 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 CDKL5-201ENST00000379989 3463 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 QRSL1P3-201ENST00000552666 1316 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 MLIP-201ENST00000274897 1815 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 LINC01994-201ENST00000496220 1808 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 AC122713.2-201ENST00000624942 3335 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 EPHA4-203ENST00000409938 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 ZNF69-202ENST00000429654 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 MMACHC-203ENST00000616135 1510 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 NPFFR2-204ENST00000395999 1866 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 CAP1-206ENST00000372805 2217 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 MUSK-205ENST00000374448 2754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 CBWD6-203ENST00000456520 1608 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 OR4A16-201ENST00000314721 1081 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 AC074375.1-201ENST00000372993 192 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 NUDT5-202ENST00000378937 919 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 TRAV12-1-201ENST00000390433 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 NPM1P31-201ENST00000399021 764 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 AL355375.1-201ENST00000405686 392 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 C2orf76-203ENST00000409523 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 RNA5SP177-201ENST00000410122 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 OR4A8-201ENST00000418689 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 AC009362.1-201ENST00000427253 406 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 ANXA2P2-201ENST00000435128 1020 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 AC079781.1-201ENST00000441505 394 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 AC239800.1-201ENST00000442049 719 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 AC093799.1-201ENST00000452411 499 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 RPS20-202ENST00000518875 671 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 DYNLRB2-204ENST00000562982 492 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 AC090826.1-201ENST00000564109 915 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 AC096708.2-201ENST00000577676 512 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 LAMTOR5-AS1-207ENST00000590826 574 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 AC113361.1-201ENST00000606683 543 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 AC016747.2-203ENST00000606876 289 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 AL359094.1-211ENST00000608350 335 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 AC087633.2-208ENST00000612877 502 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 AC103564.3-201ENST00000621194 220 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 PDAP1-205ENST00000626285 120 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 LINC00184-201ENST00000429269 2270 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 PABPC5-201ENST00000312600 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 TRIM55-202ENST00000315962 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 RAD51AP2-201ENST00000399080 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 COQ10B-202ENST00000409010 1355 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 NACAP1-201ENST00000419462 1555 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 AC011374.1-201ENST00000564471 1567 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 MORF4L2-206ENST00000433176 1965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 NAT1-206ENST00000518029 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 FYB1-210ENST00000515010 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 PIGN-238ENST00000639758 4239 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 ZNF841-203ENST00000594295 3819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 MFSD8-256ENST00000641949 1640 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 ECI2-204ENST00000380125 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 AC125232.1-201ENST00000452554 1408 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 SYT1-212ENST00000552744 2718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 RPS6KA6-201ENST00000262752 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 OR10A4-201ENST00000379829 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 SNORA70.8-201ENST00000384231 136 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 AL133268.2-201ENST00000416595 430 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 AL593856.1-201ENST00000419949 805 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 RPL5P6-201ENST00000425640 886 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 P3H2-203ENST00000427335 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 OSTCP2-201ENST00000437956 444 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SGCZQ96LD1 AL136528.1-201ENST00000443034 754 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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