Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 ZNF846-202ENST00000586293 1621 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 SLC2A14-201ENST00000340749 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC126474.2-201ENST00000623268 1750 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC091492.1-201ENST00000419844 272 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 RPL36AP55-201ENST00000454114 305 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 FCRL2-205ENST00000469986 902 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC010655.2-201ENST00000493710 662 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC096661.1-201ENST00000515870 822 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC130366.1-201ENST00000526505 1192 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AP004607.5-201ENST00000532034 217 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 NQO1-205ENST00000561500 891 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 LINC01028-201ENST00000586373 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 OR7A11P-201ENST00000597719 953 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 PTCHD3P1-201ENST00000612350 537 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC005393.1-201ENST00000617916 584 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 DAPL1-204ENST00000621326 671 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 RMDN2-AS1-207ENST00000627614 765 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 ASB8-218ENST00000629941 278 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 UBA2-202ENST00000439527 2802 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 MAS1-201ENST00000252660 9841 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 RALYL-204ENST00000518566 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 KCNMB2-201ENST00000358316 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 ASXL2-201ENST00000336112 8889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 RPLP1P10-201ENST00000413972 339 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AMMECR1-IT1-201ENST00000418848 561 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC068759.1-201ENST00000447709 470 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 DIRC3-AS1-201ENST00000452813 557 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC016722.1-201ENST00000453936 652 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AL354872.1-201ENST00000456361 967 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC026774.2-201ENST00000513990 1098 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 RNA5SP75-201ENST00000516841 111 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC037450.1-201ENST00000518129 647 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC091096.2-201ENST00000523284 587 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AL512430.4-201ENST00000603085 613 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC027506.1-201ENST00000621395 198 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 FADS2P1-201ENST00000611807 1446 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 LCP2-206ENST00000521416 1599 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 MROH9-201ENST00000367758 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC007012.2-201ENST00000623206 1676 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 MAVS-202ENST00000428216 11714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC068189.1-201ENST00000501164 2632 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 PYROXD1-201ENST00000240651 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms