Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 TFDP2-212ENST00000486111 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 GCNT3-209ENST00000560585 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 MAPK10-290ENST00000641237 2826 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC022784.6-204ENST00000520390 3442 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 KIF15-201ENST00000326047 4842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 IFT88-201ENST00000319980 3091 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 ARPP21-207ENST00000417925 3086 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 PSMD5-AS1-213ENST00000640327 3531 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 PXT1-201ENST00000454782 2108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 MPPED2-201ENST00000358117 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 MAPK10-272ENST00000641110 2724 ntAPPRIS P2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 PDE4D-210ENST00000503258 2860 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 PDZK1P1-201ENST00000401008 3498 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 LINC02073-201ENST00000588341 2845 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 MSL3-206ENST00000380693 2377 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 LINC02408-201ENST00000400306 1766 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 TDRD12-201ENST00000421545 1317 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 FAM135A-207ENST00000457062 5282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 OR4D10-201ENST00000530162 2482 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 NPIPB4-203ENST00000415645 3606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 LINC01924-201ENST00000589376 1722 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 Z93022.1-201ENST00000433228 1554 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC022306.1-201ENST00000560489 1562 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 SPATA19-201ENST00000299140 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 UGT2B4-201ENST00000305107 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 RNA5SP378-201ENST00000363646 120 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 RN7SKP50-201ENST00000364694 315 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 RSPO3-202ENST00000368317 1290 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 RNA5SP23-201ENST00000391006 105 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 SRI-202ENST00000394641 653 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 VWC2L-IT1-201ENST00000416430 467 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC008758.2-201ENST00000420038 695 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 RPL4P4-201ENST00000422486 1284 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 BRWD1-AS1-201ENST00000423274 691 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 FBP2P1-202ENST00000424473 530 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 PRSS48-201ENST00000441586 560 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 MIR4435-2HG-211ENST00000443467 826 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 RPS14P7-201ENST00000473701 448 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 RN7SL12P-201ENST00000473849 290 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC233724.1-201ENST00000503894 233 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC110741.1-201ENST00000520149 582 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 C5orf58-205ENST00000524171 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AP003032.2-201ENST00000533697 686 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 MS4A12-205ENST00000537076 1019 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 TGFB3-AS1-201ENST00000553732 580 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 FDPSP3-201ENST00000556903 1013 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 OR4N2-203ENST00000557677 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC124283.2-201ENST00000575085 318 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC007861.1-201ENST00000576671 674 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 TTN-AS1-210ENST00000578746 677 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 RPL17-208ENST00000580261 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 LINC01198-208ENST00000599175 560 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC140658.6-201ENST00000603958 201 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 Metazoa_SRP.124-201ENST00000610352 345 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 OR10R2-202ENST00000641067 1132 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 LINC01630-208ENST00000635680 4363 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 PICALM-201ENST00000356360 1958 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC109361.1-201ENST00000513220 3526 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 CLK1-215ENST00000621181 1843 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 PRKCQ-204ENST00000610727 3077 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
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