Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 C12orf45-201ENST00000280749 459 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 GOLGA8DP-201ENST00000314246 2786 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 OR10J3-201ENST00000332217 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 LRRC7-201ENST00000035383 5000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 OBP2B-201ENST00000372032 702 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 SUN5-203ENST00000375523 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 OSBP2-204ENST00000407373 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 USP17L12-201ENST00000415041 1593 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 AL358942.1-201ENST00000418595 1178 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 AP000552.2-201ENST00000422450 689 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 AL512326.3-201ENST00000424885 171 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 USP17L13-201ENST00000429667 1593 ntAPPRIS P2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 PPIAP1-201ENST00000448832 496 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 ALOXE3-203ENST00000448843 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 LMCD1-205ENST00000454244 1113 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 USP17L11-201ENST00000457736 1593 ntAPPRIS P2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 USP17L30-201ENST00000504104 1593 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 USP17L18-201ENST00000504209 1593 ntAPPRIS P2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 USP17L24-201ENST00000504481 1593 ntAPPRIS P2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 USP17L28-201ENST00000504543 1593 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 USP17L14P-201ENST00000504838 1593 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 USP17L20-201ENST00000506151 1593 ntAPPRIS P2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 USP17L21-201ENST00000506414 1593 ntAPPRIS P2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 USP17L16P-201ENST00000507155 1593 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 USP17L5-201ENST00000507227 1593 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 USP17L9P-201ENST00000508843 1593 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 USP17L25-201ENST00000509271 1593 ntAPPRIS P2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 USP17L26-201ENST00000509660 1593 ntAPPRIS P2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 USP17L22-201ENST00000511280 1593 ntAPPRIS P2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 USP17L17-201ENST00000511568 1593 ntAPPRIS P2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 USP17L29-201ENST00000511681 1593 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 USP17L19-201ENST00000515566 1593 ntAPPRIS P2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 USP17L27-201ENST00000515574 1593 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 HNRNPCP8-201ENST00000528764 888 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 ANAPC15-216ENST00000545680 872 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 AC079363.1-201ENST00000551366 1125 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 SCIMP-204ENST00000574297 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 BOD1P2-201ENST00000578494 481 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 HIGD1B-203ENST00000587021 457 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 ZNF233-203ENST00000589522 1120 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 RPSAP57-201ENST00000590033 832 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 PHF5CP-201ENST00000591298 325 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 FAM95B1-213ENST00000593047 767 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 ZNF415-218ENST00000599261 601 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 BNIP3P36-201ENST00000603076 574 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 SRGAP2-215ENST00000605610 3212 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 AC006262.4-201ENST00000613498 286 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 LINC01002-235ENST00000633951 567 ntTSL 4 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 AL353572.3-201ENST00000636536 670 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 STK31-202ENST00000355870 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 MICAL3-203ENST00000400561 3046 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 SLAMF7-201ENST00000359331 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 GGA3-205ENST00000578348 2251 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 PALB2-201ENST00000261584 4003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 C16orf62-201ENST00000251143 3894 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 STRADA-247ENST00000640679 1816 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 AL022100.1-201ENST00000636624 1678 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 PTPRT-206ENST00000373198 12746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 FUT2-202ENST00000425340 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 AC022507.1-201ENST00000548349 1505 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 BRPF3-211ENST00000534400 4254 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 LMLN-201ENST00000330198 7043 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 HUWE1-202ENST00000262854 14739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 ZNF682-203ENST00000397165 3245 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 PHC1P1-201ENST00000554937 3061 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 FLRT1-201ENST00000246841 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 RFX6-201ENST00000332958 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 ZNF790-208ENST00000615484 2451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 SLC22A8-210ENST00000545207 1622 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 RCAN1-205ENST00000443408 2315 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 PPHLN1-205ENST00000395568 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 PLA2G4D-201ENST00000290472 3584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 GPR155-202ENST00000392551 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 AL772363.1-201ENST00000371390 3222 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 SEC61A1-202ENST00000424880 3238 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 FAM83F-201ENST00000333407 15561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 FANCL-203ENST00000403295 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 SRGAP2-AS1-202ENST00000437515 2504 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 FP700111.1-201ENST00000441760 2502 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 ZNF83-211ENST00000597597 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 SLC7A8-204ENST00000422941 3018 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 KANSL3-206ENST00000431828 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 DNAH9-201ENST00000262442 13750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ATXN8OSP0DMR3 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
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