Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRB4-202ENST00000445719 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2D4-206ENST00000446008 783 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TDRG1-202ENST00000448433 1015 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FTLP18-201ENST00000453860 523 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS4XP19-201ENST00000460237 736 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL23AP8-201ENST00000479812 475 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079944.1-201ENST00000485426 495 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC122710.2-201ENST00000506093 596 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC108073.1-201ENST00000508231 674 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM60P14-201ENST00000513444 1419 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104109.4-202ENST00000518409 1082 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLN-202ENST00000525934 436 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000907.3-201ENST00000530733 322 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHBP2-201ENST00000532859 806 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC137055.1-201ENST00000549333 395 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL109628.2-201ENST00000554037 201 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01227-202ENST00000561719 755 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010536.2-201ENST00000563036 338 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EEF1B2P1-201ENST00000567221 672 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005154.1-216ENST00000582145 1101 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL136084.2-214ENST00000587726 716 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007785.3-202ENST00000601033 518 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02532-210ENST00000606430 584 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL354740.1-202ENST00000612837 290 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01176-202ENST00000628121 716 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFIB-221ENST00000637742 2166 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068205.4-201ENST00000637880 804 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAMMSON-203ENST00000641005 2168 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087885.1-201ENST00000641910 848 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093909.4-201ENST00000514297 1991 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKAP10-202ENST00000395536 1815 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP472-201ENST00000363868 119 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FABP3-201ENST00000373713 725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSNK2B-202ENST00000375866 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HEATR5A-201ENST00000382464 507 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP35-201ENST00000391257 129 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNNT3-209ENST00000397304 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R17-202ENST00000409146 569 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSPE1-202ENST00000409468 570 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C21orf140-201ENST00000410005 756 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC020983.1-201ENST00000417063 543 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008063.1-201ENST00000418335 640 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC8A1-AS1-206ENST00000439606 565 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPSA-202ENST00000443003 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNNT3-210ENST00000446240 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL392046.1-201ENST00000450742 569 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL392P-201ENST00000473024 299 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL23AP68-201ENST00000480924 445 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL7AP30-201ENST00000482859 796 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL096701.3-202ENST00000483736 615 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL700P-201ENST00000496982 294 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSD17B11-203ENST00000507286 851 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCAF13P2-201ENST00000514188 555 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCARNA20.3-201ENST00000516913 131 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C11orf65-203ENST00000525729 1263 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM126A-206ENST00000532180 643 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090092.1-202ENST00000533591 685 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RD3L-201ENST00000557640 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092718.5-201ENST00000562450 593 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMSB15B-206ENST00000569577 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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