Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AC092718.2-202ENST00000566390 556 ntTSL 4 BASIC9.21□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AL035555.1-201ENST00000404462 1790 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 ATP10B-202ENST00000327245 7566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 CRYZ-201ENST00000340866 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AL139039.3-201ENST00000413129 1475 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 CEBPZ-201ENST00000234170 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 NOVA1-204ENST00000465357 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 ZNF214-201ENST00000278314 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 VANGL1-202ENST00000355485 8691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 PRIM2-207ENST00000615550 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 SLC2A14-201ENST00000340749 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 FASLG-202ENST00000367721 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AC114812.2-201ENST00000439336 663 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 SEC11A-209ENST00000560266 1089 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 ZMYND8-221ENST00000619049 4027 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AC093227.1-201ENST00000588040 1360 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 RGS5-215ENST00000439699 1441 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 SLC8A1-204ENST00000405269 2965 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AC023818.2-201ENST00000623817 2304 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 SPEF2-211ENST00000509059 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 NEMP1-201ENST00000300128 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AL512634.1-201ENST00000566873 2432 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 MBD5-201ENST00000404807 5920 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 IGF1-206ENST00000456098 7370 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 LINC00184-201ENST00000429269 2270 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 UTY-216ENST00000624098 3636 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 SLC4A4-204ENST00000425175 7596 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AL773545.3-201ENST00000414297 706 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AC097494.1-201ENST00000512898 732 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 LIPF-205ENST00000608620 1290 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 RPS27L-208ENST00000635699 693 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 DCX-208ENST00000636035 9269 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 MAPK10-377ENST00000642006 2752 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 OVAAL-201ENST00000442621 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 ARG1-203ENST00000368087 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AP2B1-217ENST00000618940 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 LRIG3-202ENST00000379141 3667 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.3 ms