Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 RPSAP68-201ENST00000625020 438 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 RMDN2-AS1-207ENST00000627614 765 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 SLC39A12-203ENST00000377374 2639 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 AC007388.1-201ENST00000426083 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 PARP1P1-201ENST00000413631 3026 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 RIF1-205ENST00000444746 7897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 AC108099.1-201ENST00000564402 3258 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 LINC00294-201ENST00000631190 3306 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 HMBOX1-211ENST00000524238 1731 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 MORF4L2-208ENST00000441076 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 ZNF569-202ENST00000392149 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 PPFIBP1-202ENST00000318304 6001 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 MATR3-232ENST00000502929 4373 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 ZNF385B-202ENST00000409343 2750 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 LRRC28-201ENST00000301981 5971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 GABPB2-202ENST00000368918 8964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 POGZ-205ENST00000409503 4813 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 GPCPD1-201ENST00000379019 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 CDADC1-201ENST00000251108 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 USPL1-201ENST00000255304 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 TMEM126B-201ENST00000358867 989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 NALCN-202ENST00000376200 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 FCAR-205ENST00000391723 754 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 OPALIN-202ENST00000393870 3578 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 AL079341.1-201ENST00000404701 1207 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 IL1RL1-203ENST00000404917 3571 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 NF1P8-201ENST00000415351 1461 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 AC114752.2-201ENST00000424119 404 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 BRD7P6-201ENST00000431406 1860 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 RPL21P33-201ENST00000444831 484 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 AC004870.2-201ENST00000445615 831 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 AC013787.1-201ENST00000460165 307 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 RPS26P11-201ENST00000463445 348 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 RPS14P7-201ENST00000473701 448 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 LINC01206-202ENST00000474045 2240 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 RPS26P6-201ENST00000475156 348 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 DKK2-202ENST00000510463 908 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 ACRV1-203ENST00000530048 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 PSMA3-AS1-206ENST00000555037 446 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 AL358334.3-201ENST00000557343 535 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 AL132640.1-201ENST00000559594 619 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 OR4C49P-201ENST00000563891 900 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 AC126323.5-201ENST00000569913 592 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 WNK1-220ENST00000574564 1401 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 CR392039.3-201ENST00000623236 227 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 AC008626.2-201ENST00000624425 248 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 RMDN2-AS1-210ENST00000630021 1053 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 HNRNPA2B1-201ENST00000354667 3664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 ZNF587B-201ENST00000442832 3339 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 RNF214-206ENST00000531452 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 FHL1-204ENST00000370683 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 DIP2B-201ENST00000301180 8593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 MAP2-203ENST00000361559 2038 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SFTPCP11686 AL158206.1-201ENST00000563205 1965 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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