Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 BMX-201ENST00000342014 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 NUP210L-202ENST00000368553 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 FBXO7-202ENST00000397426 1888 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 EIF4A1P13-201ENST00000415667 230 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC009229.2-201ENST00000417213 351 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 STARD13-IT1-201ENST00000456087 452 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AL592464.2-201ENST00000457440 607 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 PSMA6P2-201ENST00000457574 686 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 RN7SL145P-201ENST00000469955 296 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 GBA3-201ENST00000503442 1232 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AP002026.1-204ENST00000506454 749 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC111000.1-201ENST00000514545 713 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 FBXO16-208ENST00000519471 398 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC022679.2-201ENST00000522186 813 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC022405.1-201ENST00000559841 516 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC004494.1-202ENST00000573820 480 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 SCIMP-204ENST00000574297 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC011487.2-201ENST00000600193 1228 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AL050403.2-202ENST00000603462 492 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC007255.2-201ENST00000604053 631 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 FAM13A-AS1_2.1-201ENST00000611121 108 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 CBWD6-203ENST00000456520 1608 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 RGS2-201ENST00000235382 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 TMEM59-204ENST00000371344 2473 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 CATSPER2-202ENST00000381761 1758 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 PBLD-203ENST00000336578 2449 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AP005139.1-201ENST00000580702 1647 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 RPS7-201ENST00000304921 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 RN7SKP55-201ENST00000364888 307 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 RPS3AP5-201ENST00000389400 821 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 RPL9P21-201ENST00000392269 505 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 MTERF4-205ENST00000407095 799 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 PDE11A-203ENST00000409504 2102 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AL157932.1-201ENST00000413246 363 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 SMARCA2-211ENST00000417599 980 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 LINC01522-201ENST00000428999 429 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 RPS21P1-201ENST00000434479 247 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 LSM3P3-201ENST00000436601 306 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 ST13P2-201ENST00000438916 1109 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 PGM5P3-AS1-202ENST00000442069 615 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 OR51P1P-201ENST00000447547 942 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AC108463.2-201ENST00000451230 412 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AL391422.2-202ENST00000454396 347 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AC010878.1-201ENST00000456500 1047 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AC091982.1-202ENST00000473923 343 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AL928654.1-201ENST00000476081 354 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 RN7SL259P-201ENST00000478499 253 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 TECRP2-201ENST00000503270 928 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 LECT2-203ENST00000512872 762 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AC226119.1-201ENST00000514073 682 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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RTL8BQ17RB0 AC104109.4-202ENST00000518409 1082 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AC087672.3-201ENST00000519323 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AP003084.1-201ENST00000524828 742 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 OR5M6P-201ENST00000530227 937 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 LINC00678-202ENST00000534757 798 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AC015908.3-202ENST00000579367 457 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 RN7SL311P-201ENST00000579858 306 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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